למרות שהמדע רואה בהם לא יותר מעיצובים חכמים מעשה ידי אדם, חוקרים רבים אומרים שיש הוכחה משכנעת לכך שמקורות עיגולי היבול אינם מוסברים.
הם התחילו כעיגולים פשוטים שהונחו בשדות חיטה, תירס וגידולים אחרים. המעגלים הראשונים דווחו בשנות השבעים בכפר האנגלי. יתכן והדבר הוסבר על ידי תופעות טבע כגון מערבולת, ברק כדור או סוג אחר של מערבולת טבעית.
התצורות הפכו מורכבות יותר בשנות השמונים, חלקן בצורת פיקטוגרמים שנראו כצפנים או מסרים בעלי משמעות לא ידועה. אחרים הוצגו והדגימו משוואות מתמטיות מורכבות. אלה היו חייבים להיות עבודות של אינטליגנציה כלשהי, אנושית או אחרת. התופעה נמשכה לאורך השנים, ובכל עונת קיץ היו עיצובים מורכבים יותר (ולעתים קרובות יפים).
הוויכוח המתמשך בקרב חוקרים וסקפטים רבים של מעגלי היבול היה אם הם מעשה ידי אדם או לא. עיצובים רבים נעשים בבירור ואמנם על ידי אנשים. אפילו חוקר מעגלי היבול הוותיק קולין אנדרו מעריך כי עד 80 אחוז מהם כנראה מעשה ידי אדם . אך כמה חוקרים מתעקשים כי תצורות רבות אינן - למעשה, אינן יכולות להיעשות על ידי בני אדם.
הסברים סקפטיים לתצורות גידולים נעים בין מגוחכים (תיאוריה מוקדמת אחת הייתה שהם נוצרו על ידי קיפודים רץ במעגלים) לסביר (סטודנטים חכמים). ההסברים של המאמינים היו מגוונים לא פחות, החל מעבודתם של חייזרים ועד לרעיון שהתצורות נוצרות על ידי כדור הארץ עצמו כסוג של אזהרה לאנושות.
לצידם, לספקנים יש הודאות של יוצרי מעגלי תבואה כמו דאג ודייב בבריטניה. בשנת 1991, דאג באוור ודייב צ'ורלי, שני גמלאים קשישים במקצת, עלה קדימה וטענו כי יצרו מאות עיגולי יבול במהלך 13 השנים הקודמות באמצעות קרש עץ, חבל וכובע בייסבול מצויד בלולאת חוט כדי לסייע להם ללכת בקו ישר. אף שחלק מהחוקרים טוענים שהטענה שלהם מוטלת בספק רציני, אין עוררין על כך שתצורות גידול רבות 'הונפו' על ידי אנשים שעושים מעט יותר מעיצוב מתוכנן היטב, קרשים מעץ וחבל. מטעים כאלה הוכיחו בפני עדים ומצלמות טלוויזיה שהם יכולים ליצור עיצובים גדולים ומשוכללים תוך שעות ספורות בלבד.
אך מה עם הקביעה כי תצורות היבול נוצרות בכוח על -טבעי כלשהו, מחוץ לכדור הארץ או פאר -נורמלי? מהן הראיות המחייבות כמה חוקרים להסיק כי עיגולי היבול כמעט בוודאי אינם מעשה ידי אדם? ישנם מוזרויות לחוגי גידולים 'אמיתיים', אומרים חוקרים אלה, אשר בני אדם אינם יכולים ליצור או להונות אותם. להלן כמה מהראיות המצוטטות לעתים קרובות:
מקורות:
לא ידוע. 'חריגות בצמחים'. צוות המחקר של BLT, Inc, Cambridge, MA.
לא ידוע. 'דיווחים של עדי ראייה'. צוות המחקר של BLT, Inc, Cambridge, MA.
לא ידוע. 'מעגלי חיתוך-מעשה ידי אדם או מסתורין?' BBC. 11 בנובמבר 2002, אנגליה.
טוהי, וויליאם. '' מעגלי חיתוך 'מתיחתם, 2 בריטים אומרים: מתיחה: ייתכן שהחידה המדעית נפתרה. הציירים מראים כיצד הם שיטחו תירס ליצירת דוגמאות״. לוס אנג'לס טיימס, 10 בספטמבר, 1991, לוס אנג'לס, קליפורניה.